В центре истории  Сулетта Меркури, которая прибывает с Меркурия и поступает в одно из самых передовых учебных заведений, задействованных в техносфере. В итоге главная героиня оказывается под крылом крупной корпорации, которая занимается производством и распространением мобильных доспехов. С её деятельностью будут связаны главные интриги. "Ведьма с Меркурия" - это старт новой ветки развития франшизы "Мобильный  доспех Гандам".