Конан и компания во время летних каникул отправляются в токийскую телевизионную башню "Небесное дерево", но на их глазах снайпер убивает человека. Неужели это проделки "Организации" или таки просто рядовое дело? Все окончательно запутывается, когда в погоню за преступником включаются Сера Масуми, Окия Субару и ФБР, а преступник продолжает убивать людей, среди которых есть и подозреваемые...